Prestation 1
Caractériser la réponse.
Explorer les profils transcriptomiques associés à la réponse ou à la résistance à un traitement candidat, dans vos données ou dans des cohortes publiques.
Les questions traitées
- Quels profils moléculaires sont associés à la réponse ou à la résistance ?
- Des sous-groupes se comportent-ils différemment, et avec quelle robustesse ?
- Quelles expériences ou cohortes permettraient d’éprouver l’hypothèse ?
Ce dont nous avons besoin
- RNA-seq bulk (comptages ou expression normalisée) avec identifiants d’échantillons
- Annotations de traitement et de réponse, ou critère de réponse défini
- Métadonnées cliniques ou expérimentales disponibles (pseudonymisées)
Ce que vous recevez
- Profils et sous-groupes associés à la réponse, avec tailles d’effet et incertitude
- Analyses de sensibilité et contrôle des facteurs confondants
- Figures exploitables et rapport d’interprétation
- Limites de l’analyse et étapes de validation proposées
Exemple de plan de rapport
Exemple illustratif — contenu fictif, pas des résultats de Recanthia.
- 1. Question et définition de la réponse
- 2. Description de la cohorte et contrôle qualité
- 3. Programmes régulateurs associés à la réponse (exploratoire)
- 4. Robustesse : rééchantillonnage, covariables, définitions alternatives
- 5. Hypothèses classées par niveau de preuve et validations suggérées
Déroulé d’un projet
Cadrage, faisabilité, analyse, interprétation et restitution — chaque étape est validée avec vous. Voir notre méthode et nos pratiques sur les données →
Délai et prix sont fixés au cadrage, selon les données et la question. Voir un exemple de rapport sur données synthétiques →
Les résultats sont des hypothèses de recherche. Ils ne constituent ni un diagnostic, ni une recommandation clinique, ni un test prédictif validé.
Parler d’un pilote de ce type
Présentez-nous votre candidat, vos données et votre question. Nous revenons vers vous avec une proposition de cadrage.